Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NGFRP08138 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NGFRP08138 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms