Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTSLP07711 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSLP07711 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSLP07711 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSLP07711 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSLP07711 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSLP07711 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSLP07711 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSLP07711 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms