Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
IGHG1P01857 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms