Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NSD2O96028 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NSD2O96028 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD2O96028 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD2O96028 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD2O96028 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD2O96028 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD2O96028 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NSD2O96028 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NSD2O96028 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms