Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX58O95786 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX58O95786 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX58O95786 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX58O95786 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX58O95786 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms