Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ALX3O95076 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ALX3O95076 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms