Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATG12O94817 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ATG12O94817 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms