Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLIT2O94813 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIT2O94813 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms