Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PSMD3O43242 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms