Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SOCS1O15524 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms