Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TXNDC9O14530 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TXNDC9O14530 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms