Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GOLGA8SH3BPF8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms