Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NPIPA5E9PKD4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms