Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
USP17L13C9JLJ4 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
USP17L13C9JLJ4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms