Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PATL2C9JE40 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms