Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HMGB1P1B2RPK0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms