Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HACD1B0YJ81 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HACD1B0YJ81 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms