Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3CA6NKF2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3CA6NKF2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms