Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIPT2A6NK58 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms