Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CFAP73A6NFT4 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms