Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GMNCA6NCL1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GMNCA6NCL1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms