Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms