Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCDC78A2IDD5 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC78A2IDD5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms