Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
TRAV26-1A0A087WT03 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms