Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT02

TRAV9-2, T-cell receptor alpha variable 9-2 (Fragment), humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV9-2A0A087WT02 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV9-2A0A087WT02 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV9-2A0A087WT02 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV9-2A0A087WT02 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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