Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
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SNX13Q9Y5W8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX13Q9Y5W8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX13Q9Y5W8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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