Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RCE1Q9Y256 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RCE1Q9Y256 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms