Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TRAK1Q9UPV9 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms