Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VPS4AQ9UN37 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VPS4AQ9UN37 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms