Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PALD1Q9ULE6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PALD1Q9ULE6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms