Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DSEQ9UL01 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSEQ9UL01 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms