Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TNIKQ9UKE5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TNIKQ9UKE5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms