Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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RABGEF1Q9UJ41 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RABGEF1Q9UJ41 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
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