Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MBD1Q9UIS9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms