Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DBF4Q9UBU7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms