Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DKK2Q9UBU2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DKK2Q9UBU2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms