Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EXTL2Q9UBQ6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EXTL2Q9UBQ6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms