Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PPARGC1AQ9UBK2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PPARGC1AQ9UBK2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms