Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COPG2Q9UBF2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COPG2Q9UBF2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms