Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XCL2Q9UBD3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XCL2Q9UBD3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms