Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HMG20BQ9P0W2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20BQ9P0W2 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20BQ9P0W2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HMG20BQ9P0W2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms