Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBP1Q9NZI7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms