Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GDE1Q9NZC3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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