Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C9orf78Q9NZ63 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C9orf78Q9NZ63 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms