Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MIS18AQ9NYP9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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