Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZDHHC3Q9NYG2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms