Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MS4A12Q9NXJ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms