Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLN6Q9NWW5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CLN6Q9NWW5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms