Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TDP1Q9NUW8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
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