Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMSN1Q9NSI8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms